Conda install sra-tools 2.9.6 -y
WebMar 10, 2024 · Here's a reproducible example from a linux system. I install sra-tools: module load anaconda3 conda activate fwt conda install sra-tools This installs sra … Webconda: 47.3 MB osx-64/sra-tools-2.9.6-h0a44026_0.tar.bz2: 3 years and 6 months ago bioconda 4039: main conda: 45.1 MB linux-64/sra-tools-2.9.6-hf484d3e_0.tar.bz2: 3 …
Conda install sra-tools 2.9.6 -y
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WebDec 24, 2024 · 昨天晚上使用sratools下载sra数据出现报错,之前一直能够顺利下载,检查网络连接后也没能解决。果然,重新下载sratools包后得以解决这个问题,虽然这个报是六个月前更新的。但是在将sra数据转成fastq数据的过程又出现问题。 WebFirst, I will check if sra-tools is on conda. [1]: %%bash conda search sra-tools ... conda install sra-tools This will install a suite of tools you will need to download publicly …
WebNov 22, 2024 · 用conda下载sratoolkit(sra-tools). 前期:安装sratoolkit用常规方法失败,经提醒用了 conda 下载。. 但是网上找的几串代码都不能跑成功。. 下面介绍一个万能解决的方法:. 1. 搜索sra-tools版本,选择最新的. 之前安装2.x.x的版本都失败了,看到最新的有3.0.0版本的,于是 ... Webconda: 38.0 MB linux-64/sra-tools-2.9.1_1-h470a237_0.tar.bz2: 4 years and 8 months ago bioconda ... linux-64/sra-tools-2.9.6-hf484d3e_0.tar.bz2: 3 years and 9 months ago bioconda 9860: main conda: 61.9 MB ...
WebOct 28, 2024 · This command will check the availability of all needed reference sequences (-c) for a given accession. path not found while resolving tree within virtual file system module ‘/SRR*.sra’ cannot be found.”. Check to make sure the file and path you have specified exist on your system, also check the path name for typos. 1. WebNov 6, 2024 · 这里提供两种方法,选择一种安装即可,强烈建议使用Conda方式安装. 2.1 Conda 安装. conda install -y sra-tools. 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) : Conda 安装使用图文详解. 2.2 传 …
WebNov 22, 2024 · 用conda下载sratoolkit(sra-tools). 前期:安装sratoolkit用常规方法失败,经提醒用了 conda 下载。. 但是网上找的几串代码都不能跑成功。. 下面介绍一个万能 …
WebFeb 3, 2024 · 也可以用conda指定版本: conda install sra-tools=2.9.6 -y aspera的安装,同样可源码,下载地址:IBM Aspera Connect 我这里选择3.10.1.0,解压sh运行即可,默 … busher cocdril’sWebFeb 3, 2024 · 也可以用conda指定版本:. conda install sra-tools=2.9.6 -y. aspera的安装,同样可源码,下载地址: IBM Aspera Connect. 我这里选择3.10.1.0,解压sh运行即可,默认安装在家目录以隐藏目录存在:. 也可用anaconda安装:. conda install -c hcc aspera - cli #可指定版本 conda install -c hcc aspera ... handheld films inc new yorkWebTo configure your environment for use of SRA Toolkit, run the following command: module load sratoolkit.The default version will be loaded. To select a particular SRA Toolkit version, use module load sratoolkit/version.For example, use module load sratoolkit/2.9.6 to load SRA Toolkit 2.9.6 hand held films incWebconda: 63.9 MB linux-64/sra-tools-2.11.0-pl5321ha49a11a_3.tar.bz2: 1 year and 1 month ago bioconda ... osx-64/sra-tools-2.11.0-pl5262h37d2149_0.tar.bz2: 1 year and 11 … handheld films nyc jobsWebMay 29, 2024 · 这里提供两种方法,选择一种安装即可,强烈建议使用Conda方式安装. 2.1 Conda 安装. conda install -y sra-tools. 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) : Conda 安装使用图文详解. 2.2 传 … busher cocodrilsWebNov 15, 2024 · Welcome to the sra-tools wiki! SRA Toolkit 3.0.1 November 15, 2024. Users can now complete the vdb-config process without the interactive tool requirement. This … handheld films nyc store hoursWebThis repository is frozen. All future development will take place in GitHub repository ncbi/sra-tools (this repository), under subdirectory ngs/. ncbi/ncbi-vdb. This project's … handheld fetal heart doppler